1. Извлечение из протоколов заседаний отделения химии физико-химической секции VII съезда естествоиспытателей и врачей в Одессе // Журнал Русского Физико-Химического Общества. — 1883. — Т. 15, отд. 1. — С. 375, 380. — В содерж.: Сообщения И. М. Пономарева: 1) О строении аллантоксановой кислоты; 2) О циануровых эфирах и о строении циануровой кислоты. —*

2. Исследования соединений группы мочевой кислоты / И. М. Пономарев // Журнал Русского Химического Общества. — 1879.

3. Исторический очерк химической лаборатории Харьковского Технологического Института / И. М. Пономарев // Ломоносовский сборник : материалы для развития химии в России. — Москва : Типогр. Мамонтова А. И, 1901. — С. 1–8. —*

4. К вопросу о строении циануровой кислоты / И. М. Пономарев // Журнал Русского Химического Общества. — 1887.

5. К истории производных группы мочевой кислоты / [Соч.] И. Пономарева. — Одесса : Тип. Г. Ульриха, 1878. — [2], 72 с.

6. К истории производных группы мочевой кислоты / И. Пономарев // Журнал Русского Физико-Химического Общества. — 1879. — Т. 11, отд. 2. — С. 12–24, 46–59. —*

7. К истории уроксановой кислоты и о строении аллантоина / И. М. Пономарев // Журнал Русского Химического Общества. — 1894. ― Т. 26 (2). — С. 7.

8. К строению уроксановой кислоты и о строении аллантоина / И. М. Пономарев // Журнал Русского Химического Общества. — 1895.

9. Краткий обзор преподавания качественного анализа в Киевском политехническом институте / И. Пономарев. — Киев : Тип. С. В. Кульженко, 1909. — 13 с.

10. Курс органической химии : читаный в Харьков. практ. технолог. ин-те проф. И. М. Пономаревым / И. М. Пономарёв. — Харьков : Лит. Деденко, 1891. — 411 с. : табл., факс. —*

11. Курс органической химии : лекции проф. Харьков. технол. ин-та И. М. Пономарева : чит. в 1901–1902 акад. г. / И. М. Пономарев ; сост. студент Г. А. Лопато. — Харьков : Типо-лит. С. Иванченко, 1901. — [2], 381, 191 с.

12. О некоторых производных персульфоциана / И. М. Пономарев // Журнал Русского Химического Общества и Физического Общества. — 1876. ― Т. 8, отд. 1. — С. 210–226. —*

13. О строении циануровой кислоты : исслед. магистра / [Соч.] И. М. Пономарева. — Одесса : Тип. «Одес. вестн.», 1885. — [2], 60 с.

14. О циануровых эфирах и строении циануровой кислоты / И. М. Пономарев // Журнал Русского Химического Общества. — 1887.

15. Об аллантоксановой кислоте / И. М. Пономарев // Журнал Русского Химического Общества. — 1884.

16. Органическая химия / И. М. Пономарев, проф. Харьков. практ. технолог. ин-та. — Харьков : [Б. и., б. г.]. — 330, [2] с. : рис. —*

17. Органическая химия : [извлечения из периодических изданий по химии] // Журнал Русского Физико-Химического Общества. — 1882. — Т. 14, отд. 1. — С. 421–422. — В содерж.: Пономарев И. М. Сообщение об эфирах циановой и циануровой кислот. —*

18. Отношение йодистого ацетила к серебру и меди / И. М. Пономарев // Berichte der Deutschen chemischen Gesellschaft. — 1871.

19. Протоколы заседаний секции химии IX съезда естествоиспытателей и врачей в Москве // Журнал Русского Физико-Химического Общества. — 1894. — Т. 26, вып. 1. — С. 7. — В содерж.: сообщение И. М. Пономарева «К истории уроксановой кислоты и о строении аллантоина». —*

20. Синтез парабановой кислоты / И. М. Пономарев // Bulletin de la Societe Chimique de France. — 1872.

21. Тиамелин / И. М. Пономарев // Comptes rendus hebdomadaires des Seances de l’Academie de Science. — 1875.

22. Sur la thiameline nouveau derive du persulfocyanogene / И. М. Пономарев // Comptes rendus hebdomadaires des Seances de l’Academie de Science. — 1875.

23. Schwefelharnstoff und Silberharnstoff / J. Ponomareff // Bulletin de la Societe Chimique de France. — 1875.

24. Über das Pseudoschwefelcyan und seine Derivate / von J. Ponomareff aus Russland. — Göttingen : E. A. Huth, 1875. — 45 р.

25. Ueber Cyan und Cyanursaureaether / J. M. Ponomarew // Berichte der chemischen Gesellschaft zu Berlin. — 1882.

                                                                          
* — наявність видання у фондах НТБ НТУ "ХПІ"